您现在的位置是: 刘滨

国家级高层次人才

姓名:刘滨
所在学科:计算机科学与技术
职称:教授
联系电话:010-68911310
E-mail:bliu@bliulab.net
通信地址:北京市海淀区中关村南大街5号威尼斯87978797中心教学楼637A

个人信息

  刘滨,男,1981年7月生,博士,教授,博士生导师,国家级领军人才。2010年在哈尔滨工业大学获得博士学位,后赴美国俄亥俄州立大学从事博士后研究工作。2012年在哈尔滨工业大学(深圳)担任助理教授,2014年晋升为副教授,2015年聘任为博士生导师,2016年破格晋升为教授,2019年5月调转到威尼斯87978797工作。

  每年招博士生3名,硕士生3名,欢迎对大数据、人工智能、自然语言处理、及其在生命健康大数据分析的应用研究有兴趣的同学加入课题组。欢迎电话或邮件联系。

科研方向

  主要从事大数据、人工智能、自然语言处理、及其在生命健康大数据分析的应用研究。


代表性学术成果

       发表SCI论文120余篇,其中5篇论文入选“中国百篇最具影响国际学术论文”。

代表性论文:

(1) Hong-Liang Li; Yi-He Pang; Bin Liu*; BioSeq-BLM: a platform for analyzing DNA, RNA and protein sequences based on biological language models, Nucleic Acids Research, 2021, 49(22):e129

(2) Bin Liu*; Xin Gao; Hanyu Zhang ; BioSeq-Analysis2.0: an updated platform for analyzing DNA, RNA and protein sequences at sequence level and residue level based on machine learning approaches, Nucleic Acids Research, 2019, 47(20): e127

(3) Yihe Pang; Bin Liu*; DMFpred: Predicting protein disorder molecular functions based on protein cubic language model, PLOS Computational Biology, 2022, 18(10): e1010668

(4) Wenxiang Zhang; Bin Liu*; iSnoDi-LSGT: identifying snoRNA-disease associations based on local similarity constraints and global topological constraints, RNA, 2022, 28(12): 1558-1567

(5) Yi-Jun Tang; Yi-He Pang; Bin Liu*; IDP-Seq2Seq: identification of intrinsically disordered regions based on sequence to sequence learning, Bioinformatics, 2020, 36(21): 5177-5186

(6) Yi-Jun Tang, Ke Yan, Xingyi Zhang, Ye Tian, Bin Liu*. Protein intrinsically disordered region prediction by combining Neural Architecture Search and Multi-objective genetic algorithm. BMC Biology 2023; DOI: 10.1186/s12915-023-01672-5.

(7) Jialu Hou; Hang Wei; Bin Liu*; iPiDA-GCN: Identification of piRNA-disease associations based on Graph Convolutional Network, PLOS Computational Biology, 2022, 18(10): e1010671

(8) Wenxiang Zhang; Jialu Hou; Bin Liu*; iPiDA-LTR: Identifying piwi-interacting RNA-disease associations based on Learning to Rank, PLOS Computational Biology, 2022, 18(8): e1010404

(9) Yi-Jun Tang; Yi-He Pang; Bin Liu*; DeepIDP-2L: protein intrinsically disordered region prediction by combining convolutional attention network and hierarchical attention network, Bioinformatics, 2022, 38(5): 1252-1260 (期刊论文)

(10) Jun Zhang; Ke Yan; Qingcai Chen; Bin Liu*; PreRBP-TL: prediction of species-specific RNAbinding proteins based on transfer learning, Bioinformatics, 2022, 38(8): 2135-2143

(11) Ke Yan; Hongwu Lv; Yichen Guo; Wei Peng; Bin Liu*; sAMPpred-GAT: prediction of antimicrobial peptide by graph attention network and predicted peptide structure, Bioinformatics, 2023, 39(1): btac715

(12) Ke Yan; Hongwu Lv; Yichen Guo; Yongyong Chen; Hao Wu; Bin Liu*; TPpred-ATMV: therapeutic peptide prediction by adaptive multi-view tensor learning model, Bioinformatics, 2022, 38(10): 2712-2718

(13) Xiaopeng Jin; Qing Liao; Hang Wei; Jun Zhang; Bin Liu*; SMI-BLAST: a novel supervised search framework based on PSI-BLAST for protein remote homology detection, Bioinformatics, 2021, 37(7): 913-920

(14) Xiaopeng Jin; Qing Liao; Bin Liu*; S2L-PSIBLAST: a supervised two-layer search framework based on PSI-BLAST for protein remote homology detection, Bioinformatics, 2021, 37(23): 4321-4327

(15) Jun Zhang; Qingcai Chen; Bin Liu*; iDRBP_MMC: Identifying DNA-Binding Proteins and RNA Binding Proteins Based on Multi-Label Learning Model and Motif-Based Convolutional Neural Network, Journal of Molecular Biology, 2020, 432(22): 5860-5875


承担科研情况

  主持国家自然科学基金青年基金、面上项目、优秀青年科学基金,杰出青年科学基金、联合基金重点项目、北京市杰青项目、广东省杰青项目、教育部霍英东青年教师基金。


所获奖励

2023年国家杰出青年科学基金

2022教育部自然科学二等奖(排名第一)

2019-2020入选全球前2%顶尖科学家榜单

2020、2021、2022爱思唯尔中国高被引学者

2019年北京市自然科学杰出青年基金

2019 威尼斯87978797特立青年学者

2018年国家优秀青年科学基金

2018年教育部霍英东青年教师基金

2016年广东省自然科学杰出青年基金

2016年广东特支计划青年拔尖人才

2016年深圳市青年科技奖

2016年哈尔滨工业大学青年拔尖教授


社会兼职

  担任中国计算机学会(CCF)杰出会员、生物信息学学会生物医学数据挖掘与计算专业组(筹)副主任、广东省生物信息学会常务理事、中国计算机学会生物信息学专业组委员、人工智能学会生物信息学与人工生命专委会委员、国际会议IEEE BIBM 2016 Tutorial共同主席、国际会议APBC14、APBC15、GIW/InCoB2015、GIW2016、ICBBB2020程序委员,担任多个国际期刊编委和四十余种SCI期刊的审稿人。

备注