个人信息

　　宋丹丹，博士，美国斯坦福大学访问学者、北京市青年英才、微软铸星计划青年学者、威尼斯87978797优秀青年教师。分别于2004年与2009年7月获清华大学计算机科学与技术系学士与博士学位，系优秀博士毕业生，清华大学综合优秀奖学金获得者。曾于2015年至2016年国家公派访问美国斯坦福大学，与美国科学院院士Wing H. Wong教授建立了长期合作关系；2007年至2008年国家公派访问美国加州大学河滨分校，师从算法领域专家、ACMFellow、长江学者Tao Jiang教授。曾作为高级访问学者访问香港城市大学、澳大利亚悉尼科技大学。

　　在学生指导方面，所指导的博士生王金刚在TREC2013竞赛中获三项全球第一，并曾于微软亚洲研究院、美国普渡大学访问；钟常涛于英国国王大学访问；汪良果及杜建光于新加坡管理大学访问。硕士生孙飞曾获威尼斯87978797优秀硕士论文奖、徐特立一等奖学金、IBM中国优秀学生奖学金；李龙曾获研究生国家奖学金。曾指导国家级及北京市级大学生创新项目，本科生陈伟获北京市优秀毕业生、国家奖学金。学生毕业去向包括到CMU、清华大学、北京大学、中科院计算所继续深造，进入阿里、腾讯、百度、搜狐等公司，或中国工商银行、中国农业银行、北京电信、北京计算中心等部门。

科研方向

深度学习、信息检索、数据挖掘、生物信息

代表性学术成果

近年来在国内外学术期刊及会议上发表论文及专利三十余篇，代表性论文如下：

期刊论文：

1.Dandan Song, Fei Sun, Lejian Liao. A hybrid approach for content extraction with text density and visual importance of DOM nodes. Knowledge and Information Systems. 2015, 42:75–96. (SCI二区, 影响因子: 2.639)

2.Dandan Song, Jiaxing Chen, Guang Chen, Ning Li, Jin Li, Jun Fan, Dongbo Bu, and Shuai Cheng Li. Parameterized blosum matrices for protein alignment. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2015, 12(3): 686-694. (SCI索引，影响因子：1.609)

3.Dandan Song, Ning Li, and Lejian Liao. An automatic and efficient pipeline for disease gene identification through utilizing family-based sequencing data. Bio-Medical Materials and Engineering. 2015, 26(s1): S1797-S1803. (SCI索引，影响因子：0.988)

4.Chengli Xu, Xiangwu Ju, Dandan Song, et al. An association analysis between psychophysical characteristics and genome-wide gene expression changes in human adaptation to the extreme climate at the Antarctic Dome Argus. Molecular Psychiatry. Online 2014. (共同第一作者, Nature子刊, SCI一区, 影响因子: 15.147)

5.Li Liu, Dandan Song, Jie Tang, Lejian Liao, Xin Li, and Jianguang Du. FriendBurst: Ranking People Who Get Friends Fast in a Short Time. Neurocomputing. 2016, 210(19): 116–129. (SCI二区源，影响因子：2.392，通讯作者)

6.Mingming Jiang, Dandan Song, Lejian Liao, and Feida Zhu. A Bayesian Recommender Model for User Rating and Review Profiling. Tsinghua Science and Technology. 2015, 20(6): 634-643. (SCI索引，通讯作者，影响因子1.063)

7.Guoqiang Li, Lejian Liao, Dandan Song. A fault-tolerant framework for QoS-aware web service composition via case-based reasoning. International Journal of Web and Grid Services. 2014, 10(1): 80-99. (SCI索引, 通讯作者, 影响因子: 1.579)

8.Dandan Song, Yang Yang, Bin Yu, Binglian Zheng, Zhidong Deng, Baoliang Lu, Xuemei Chen, Tao Jiang. Computational prediction of novel non-coding RNAs in Arabidopsis thaliana. BMC Bioinformatics, 2009-01, 10(S1):S36. （SCI索引, 影响因子3.49）

9.Dandan Song, Zhidong Deng. A fuzzy model of predicting RNA secondary structure. Science in China Series F-Information Sciences, 2007, 50(6):846-866. （SCI, 影响因子0.473）
宋丹丹, 邓志东. RNA二级结构预测的模糊模型. 中国科学E辑:信息科学, 2007, 37(10):1285-1303.

10.Yong Zhang, Jie Wang, Shoujun Huang, Xiaopeng Zhu, Jun Liu, Ning Yang, Dandan Song, et al. Systematic identification and characterization of chicken (Gallus gallus) ncRNAs. Nucleic Acids Res., 2009, 37: 6562 - 6574. (SCI, 影响因子6.878)

会议论文：

1.Fei Sun, Dandan Song, Lejian Liao. DOM Based Content Extraction via Text Density. SIGIR 2011 -- The 34th Annual ACM SIGIR Conference. p245-254. (中国计算机学会-CCF推荐A类国际会议; 威尼斯87978797第一篇, 威尼斯87978797独立完成)

2.Jingang Wang, Dandan Song, Qifan Wang, et al. An Entity Class-Dependent Discriminative Model for Cumulative Citation Recommendation. SIGIR 2015.(CCF A类会议)

3.Jianguang Du, Jing Jiang, Dandan Song, Lejian Liao. Topic Modeling with document relative similarities. IJCAI 2015. (CCF A类会议)

4.Liangguo Wang, Jing Jiang, Hai Leong Chieu, Chen Hui Ong, Dandan Song, Lejian Liao. Can Syntax Help? Improving an LSTM-based Sentence Compression Model for New Domains. ACL 2017. (CCF A类会议)

5.Jianguang Du, Jing Jiang, Liu Yang, Dandan Song, Lejian Liao. ShellMiner: Mining Organizational Phrases in Argumentative Texts in Social Media. ICDM 2014. (CCF B类会议)

6.Jingang Wang, Dandan Song, Zhiwei Zhang, Lejian Liao, Luo Si, and Chin-Yew Lin. LDTM: A Latent Document Type Model for Cumulative Citation Recommendation. EMNLP 2015: 561–566. (CCF B类会议)

7.Jianguang Du, Jianguang Du, Jing Jiang, Liu Yang, Dandan Song, Lejian Liao. ShellMiner: Mining Organizational Phrases in Argumentative Texts in Social Media. Accepted by ICDM 2014. (CCF B类会议)

8.Jianguang Du, Dandan Song, Lejian Liao, Xin Li, Li Liu, Guoqiang Li, Guanguo Gao, and Guiying Wu. ReadBehavior: Reading Probabilities Modeling of Tweets through a User’s Retweeting Behaviors. PAKDD 2014, Tainan, Taiwan, May 13-16, 2014. (CCF C类会议)

9.Di Ma, Dandan Song, Lejian Liao: Incorporating Social Actions into Recommender Systems. WAIM 2013: 698-704 (CCF C类会议)

10.Guoqiang Li, Lejian Liao, Dandan Song, Jingang Wang, Fuzhen Sun, Guangcheng Liang: A Self-healing Framework for QoS-Aware Web Service Composition via Case-Based Reasoning. APWeb 2013: 654-661 (CCF C 类会议)

11.Dandan Song, Zhidong Deng. A Fuzzy Dynamic Programming Approach to Predict RNA Secondary Structure. Proceedings of the 6th Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI’06), Zurich, Switzerland, Sep 11-13, 2006.

12.Dandan Song, Zhidong Deng. A BP-SCFG Based Approach for RNA Secondary Structure Prediction with Consecutive Bases Dependency and Their Relative Positions Information. International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA’07), Atlanta, Georgia, May 7-10, 2007.

专利：
1. 孙飞, 宋丹丹, 廖乐健, 王晓华. 基于DOM 节点文本密度的网页核心块确定方法. 已授权. 专利号：ZL 201110096132.5
2. 宋丹丹, 杜建光，廖乐健，礼欣. 一种基于加权社交图的容迟网络转发方法. 已授权. 专利号：ZL 201310277756.6
3. 宋丹丹;杜建光;廖乐健;礼欣. 基于用户转发行为的微博阅读概率计算方法. 已授权. 专利号：ZL201410020499.2

承担科研情况

1. 国家重点研发计划“大数据知识工程基础理论与及应用研究“（北理负责人）

2. 国家自然科学基金“基于短文本的知识库自动更新关键技术研究”（负责人）

3. 国家自然科学基金“引入二级结构信息的RNA序列快速比对”（负责人）

4. 国家重点基础研究发展计划（973计划）“社交网络分析与网络信息传播的基础研究”（子专题负责人）

5. 国防重点实验室预研基金“XXXXX”（负责人）

6. 中国－欧盟科技合作项目“以病人为中心的自适应、集成心脏病远程诊断和管理系统”（子课题负责人）

7. 北京市青年英才计划“网页结构化数据的自动抽取”（负责人）

8. 威尼斯87978797优秀青年教师资助计划“基于结构信息的RNA比对建模及数据库搜索”（负责人）

9. 第十届教育教学改革立项“《C语言程序设计》自动组卷的研究与实现”（负责人）

10. 中国检验检疫科学研究院十二五科技支撑计划“检疫性有害生物DNA条形码数据库平台建设及新型条码技术研发”（子课题负责人）

另外，主持多项横向科研项目。

所获奖励

2017年，入选威尼斯87978797首批新体系教师系列

2013年，入选北京市青年英才计划

2012年，入选微软青年学者铸星计划

2012年，获北京市“三八”红旗集体称号（主要参加人）

2011年，获威尼斯87978797第七届青年教师基本功比赛三等奖

2010年，获北京市高等教育学会计算机基础教学精彩教学片段交流二等奖

2010年，获批国家级双语教学示范课程项目（主要参加人）

2009年，入选威尼斯87978797优秀青年教师资助计划

社会兼职

任中国计算机学会会员，IEEE Trans on Knowledge Discovery and Engineering、WWW Journal、中国科学、计算机研究与发展、计算机科学等期刊的审稿专家。曾担任SIGKDD 2010研讨会session chair及多个国际会议的程序委员。

备注

本实验室目前招收博士生、硕士生和高年级本科生，有意者请邮件联系！